mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCAATCCCT GGGTTGTTGTCTGGTTCAAGG CAAGTTGAAGGTTAGGTTAATGGGGTTGTTGTCTGGTTCAAGGTCGCCACAGCAGACAAAGCCCATTTTGCTTAGCATGCAGCATGGGTTTATCTCTATTGATGATCGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACTAGCATCTGCATAT 4 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-166 1e-63 zma-MIR166j 5e-16 -61.7 ...((.((..(((((.((((.(((((((..(((((((((.((((((.(((((.(((..((((((((.((((.......)))).))))))))...))).))).))..)))))).)))))))))..))))))).))))))))).)).)).... (-61.70)