mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCC GAATGTTGTCTGGTTCTAGG TGTGGAATGTTGTCTGGTTCTAGGCCTCTCTCTACATGCAAGCATGGATGTAGTAGCAGCCTACTGCAATTGCTTGCTGGGACCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCA 4 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-166 2e-55 osa-MIR166a 0.00000002 -48.9 ...((((((..(((((((((.((((((..........(((((((....((((((((....))))))))..))))))).))).))).)))))))))..))))))..... (-48.90)