mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT GCCGCCGCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCTGCCGCCGTGCTCGGACGGGACAGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCCGAGCCGGAGCAGCCG 3 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR168 4e-53 sof-MIR168a 1e-31 -65.8 ...((.((.(((.(((((..(((((((((((((..(((((.(((((((((....))).)))..))).)))))..)))))))))))))..))))).))).)).)).. (-65.80)