mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCGGTCACCTTGGCTAGCC TGGCGAGAGCCTGCCTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTACACGGCCTTGCGAGTTCCGGTTGCATGGCCAGTTCAGTTGGGTTTGTGGGCGGTCACCTTGGCTAGCCTGAGTGGCTCTTGCCTG 0 3 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_5 4e-66 sbi-MIR169d 4e-44 -70.8 .((((((((((...(((.(((((((((((.(((((.(((((((.((((.(((((.......))))).)))).(..(....)..).)))))))))))))))))))).))).))).)))))))))).. (-70.80)