mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGCC CGATGAGAGCACTGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGGCCTCCACTCCACCTGCGGCAGGAGGCTCTTCTTCTGCGCGCGCGTGTGTGTGTGGTTGTCGATCGCAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTCAGCGGCTCTCATCCT 0 3 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_5 3e-79 zma-MIR169k 6e-22 -85.6 .(((((((((...(((..((((((((((((.((((.(((((((..(.((((.(((((((((((((((((....)))))))).)))).).))).).)))).....)..)))))))))))))))))))).)))..))).))))))))).. (-85.60)