mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCATGTCTTCCTTGGCTACT TAGCCAAGGATGACTTGCCTAGCTATATGCCTGAGAGCCTGTCTCTTGGTGGTAAATTTGTATGTGCTGAGCATATAGGCATGTCTTCCTTGGCTACT 2 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_5 1e-49 zma-MIR169f 0.000001 -40.7 ((((((((((.(((.((((((......((((.(((((.....)))))...))))........(((((...))))))))))).))).)))))))))).. (-40.70)