mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGAATGACTTGCCTA GGCAGGTCTTCTTGGCTAGC GATGGAGAGCCCCCTTTTGCTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCATGCCCTCTGTTGGCAATTCCTCCAGCCATGGAGATTGCACAAGGTGAATTTTTGCGGCATAGATGATGGATGCAATGTGGCTGCATGGGCAGGTCTTCTTGGCTAGCCAGAGTGCTCTCATCCA 0 1 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_5 1e-91 zma-MIR169o 7e-28 -84.8 ((((.(((((...((((.((((((((((((.((((((((((((((.(((.(((.((((((((..(((((....)))))))))).))).).))....(((((.(((.....)))..)))))...))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))).. (-84.80)