mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAGGTTCTTCTCTTTGGCTACA TGTAGCCAAGGATGACTTGCCGGCCGATCGATGCCTCATCCCTGTCCGGGAACGTCATGCATGTGATGCAAACTGTGAGGCCGCATCGTCGATCGACCGGCAGGTTCTTCTCTTTGGCTACAC 1 3 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_2 2e-64 ssp-MIR169 0.0000000004 -65.7 ((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((((.....)))..((((((....))))))......)))))))......)))))))).))))))))))....)))))))))))). (-65.70)