mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCTGTCCTTGGCTACA CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTCAAATTTGAAGCGTCGTCTAAGCTGCTGAGGCTTAATAAAAACTTAGTCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTACA 1 1 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_2 6e-49 zma-MIR169c 0.00000000008 -47.05 .((((((((((((((((((((((...........((((.(((.(......).))).))))...........)))))))))))).))))))))))... (-47.05)