mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTCCTTGGCTAGC TAGCCAAGGATGACTTGCCTATATCCTCTCTAAAGGATCAGCAAATATTGAGGCTTCTAGTGGTCTCATATGGGCAGTCTCCTTGGCTAGCC 0 2 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_5 5e-46 sbi-MIR169n 9e-29 -42.1 ((((((((((.((((.(((((((((((......))))...........(((((((......))))))))))))))))))))))))))))... (-42.10)