mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTCCTTGGCTAGCC GGTAGCCAAGGATGACTTGCCTATATCCTCTATGAAGGATCAGCAAATATCGAGGCTTTGAGTGGTCTCATGGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCT 0 3 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR169_5 1e-46 sbi-MIR169m 9e-29 -43.7 ((((((((((((.((((.(((((.(((((......)))))...........((((((......)))))).)))))))))))))))))).))). (-43.70)