mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGCGCCAATATC TATTGGTGAGGTTCAATCCGA TATTGGTGAGGTTCAATCCGATGATAGGTTTTACAAACAGCTGTAAAATCAGTATCTGATTGAGCCGCGCCAATATC 4 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR171_1 8e-23 zma-MIR171n 3e-31 -36.6 ((((((((.(((((((((.((((...(((((((((......)))))))))..)))).))))))))).)))))))).. (-36.60)