mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGATTGAGCCGCGTCAATATC TATTGGCGCGCCTCAATCCGA GGTATTGGCGCGCCTCAATCCGAAGGCGTGGCTGATTTGGCATGGCAGCCATGTTCTTGGATTGAGCCGCGTCAATATCTC 1 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR171_1 2e-39 zma-MIR171m 3e-28 -51.5 ((((((((((((.((((((((((..(((((((((...........)))))))))..)))))))))).)))))))))))).. (-51.50)