mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGCGCCAATATC TATTGGTGAGGTTCAATCAGA GCGAGCGATATTGGTGAGGTTCAATCAGATCATCAGATGATGTATTTTAAATTTACATGCATGAAGGTGAATCCCCAGGGACTGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTC 1 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR171_1 2e-55 vvi-MIR171e 0.00000008 -46.3 ..(((.((((((((((.(((((((((((.(((((..((((((((.........))))).)))...))))).(((....)))))))))))))).)))))))))).))). (-46.30)