mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAATCTTGATGATGCTGCAC GCAGCAGCATCAAGGTTCGCC TCGGAGCCGACTCTCTGCAGGTGCAGCAGCATCAAGGTTCGCCAGCAGCAAGCGATCGATCGAGGCGTGTGTGTGTGAATCTTGATGATGCTGCACCAGCAATGAGCCGGCCGGC 1 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-172 3e-48 osa-MIR172c 0.000000006 -62.5 .(.(.((((.(((..(((.(((((((((.((((((((((((((((((((...(((....)))..)).))).)).))))))))))))).))))))))).)))..))).))))).). (-62.50)