mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCTATCCTGAGCTCCA TGAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTAGGAAAACACATAGATTGGAGCTAGCCATGAGGAGAAAGAGAGAGAGAGGCAGCAGAGCGAGATGCATGTGAATCTCTGAATCTGCTCATCTCTTTCTCTTTCTCAAGGTTGGTTCTGTCTATCAATCTGAAGCGCTATCTATCCTGAGCTCCAC 3 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR390 0.00004 zma-MIR390a 7e-19 -93.1 ((.(((((((((.(((((((((...(((......((((((.((((((((((.....((((((((((((((((.(.((((((..(((((........)))))....))))))).))))))))))))))))..))))))))))))))))...)))...))))))))).))))))))).)). (-93.10)