mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCCTTCAAGCACTTCATGA ACAATGTTTGGTGTTACCACGAGTTCCCTTCAAGCACTTCATGAGGCACCATTAAATAACTCTATTTAAGATTAGGTGTAATATGAAGTGTTTGGGGGAACTCTTGGTGATACTCAACATCG 0 1 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-395 2e-52 sbi-MIR395h 2e-21 -62.5 ...(((((.((((((((((.(((((((((.(((((((((((((..(((((.(((((((....))))))).....)))))..)))))))))))))))))))))).)))))))))).))))).. (-62.50)