mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAAGTGCTTGGGGGAACTC GTTCCCTTCAAGCACTTCACAT GTTCCCTTCAAGCACTTCACATGGAGCATTATTTGTCTTGGAGAAAGCTTAATTTGATGCATTGTGAAGTGCTTGGGGGAACTC 2 1 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-395 3e-41 zma-MIR395k 7e-17 -39.5 (((((((.(((((((((((((....((((((.(((.(((.....)))..)))..))))))..)))))))))))))))))))).. (-39.50)