mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA ACATGGCCCTCCTTGCCGTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATGCTGGTAGTGCTGTGTGCATCCGTTCCAATATTCCAAGAGGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTGCAGAGAGAGACCAG 1 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR396 8e-55 zma-MIR396a 1e-19 -52.1 ...((((.(((.((((.((.((((((((((((.(((((((((...((((.((((.((.(.((....)).))).)))))).))..))))))))).)))))))))))).)).)))).))).).))). (-52.10)