mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCACAGGCTTTCTTGAACTG GTTCAAGAAAGTCCTTGGAA CTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGATCGCGTGCTCTTAGCTTGCTTGCTCTCGCTCGCTTTGTGTTGATGGTTCAAGAAAGTCCTTGGAA 3 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR396 2e-48 far-MIR396 0.00000000008 -42.9 .((((..((((((((((((((((.(((.(((..(((.((....(((......)))...)).))).))).))).))))))))))))))))..)))). (-42.90)