mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGGCTTTCTTGAACTG GTTCAAGAAAGCCCATGGAAAC TTTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGGGGGTAGAAACCTTGCTGGGTTTGGTTCCCATGTCGGATGGAATGCTTGGCTCCTCCCAGCGATTCTTCCCCGGCCGTGAGTGAATTGAATTGCGGGGTTTCTCGCTTCGCTCGGCCGGCTCTACCTGTTGATGGTTCAAGAAAGCCCATGGAAAC 2 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR396 2e-103 osa-MIR396e 0.00000000000001 -87.01 ((((((..((((((((((((((((.(((.((((((..(..((((((....)))))).)..))))))..(((.((((((((.((.....)).))).))))))))((((((..(((((((.......(((((....))))))))))))))))))........))).))))))))))))))))..)))))). (-87.01)