mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTGAGTGCAGCGTTGATG CCGGCGCTGCACTCAATT TCATTGAGTGCAGCGTTGATGAGCCAGCTGGCCGGCCAGCCGTGCGTCCGCCGCCGGCGCCGGCCACGGCTCACCGGCGCTGCACTCAATT 3 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR397 2e-45 zma-MIR397b 0.000001 -68 ..((((((((((((((((.((((((.(.((((((((..((((.(((.....)))))))))))))))))))))).)))))))))))))))). (-68.00)