mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG GGGTACATCTCCTTTGGCACA CATATGCTGAGCATGAATTACAGGGTACATCTCCTTTGGCACAGATGCATGCAGCAGAATGCATATATGCATATGCGAAACTGTCGAGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCGATTCTAGGCTCTGCAAT 2 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-399 4e-57 zma-MIR399c 0.00000000000003 -63 ....(((.((((..((((..(((((((..(((((((((((((..(((((((..((.....))...)))))))...(((.....)))...)))))))))))))..)))))))..))))...)))).))).. (-63.00)