mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGATTTGCCCAG GGGCCATTTCTCCTTGGGCAGA CATATGCGAGTCGAGGATTACCGGGCCATTTCTCCTTGGGCAGAGTAATTGAATTTTACTTTGCTGGATCCGGTTTGCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCAGCAATCCACATTTGTAATAT 4 1 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-399 3e-51 osa-MIR399f 0.000000000002 -49.53 ....(((((((.(.(((((.(.((((.(..(((((((.((((((((((..............((((....)))))))))))))).)))))))..))))).).))))).)))))))).... (-49.53)