mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG GTGCGGTTCTCCTCTGGCATG AGTGCGGTTCTCCTCTGGCATGAACGACGGCTGGAGCAGCTTGCCACATGGCTCGGCCACGGCCCTTGCTTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCC 3 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-399 1e-46 zma-MIR399h 8e-17 -45.2 ((.(((((((((((.(((((....(((.(((((..((.....(((....)))...))..))))).)))..))))).))))))))))).))... (-45.20)