mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT TTAAACCTCTAACTGTGACTGATTTTTTTGGAAAAATATATTAACATCTGCAAGCTGAAATAAGTGCACTATCAAGACATGGAGAATTTAATGAAACTAATTTGATGTCATAGATATTGGCGTATTTTTCTATAAACTTGGTGAAAGTTAGAGAAGTTTGACTT 4 2 3' arm Sorghum_bicolor mirbase 100 ssp-MIR437a 1e-17 -38.8 ((((((((((((((.(.((..(.(((..((((((((((..((((.(((((...(((......)))..........(((((...(((((..........))))).))))).))))).))))..)))))))))).))).)..)).).))))))))..))))))... (-38.80)