mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT TAAATCTCTCTAATATTTACCAAGTTTATAGAAAAATGCATCAACATTTCCAACATCAAATTAGTATCATTAAATTCTCCGTGAAATATATTCATAGTGCATTTACTTGAACTTGTAGATTTTAATAGTTTTTTTTTTCTAAAAACTTGGTGAAAGTTAGAGAAGTTTGACTT 7 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase 100 sbi-MIR437g 4e-17 -41.2 ((((..((((((((.((((((((((((.((((((((......((((((......(((.....(((.(((.(((((.(.(..((((.....))))..).).)))))..))))))....)))...))).)))...)))))))).)))))))))))).))))))))..)))).... (-41.20)