mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGTACCCTCTCTCTTCTTC AGAAGAGAGAGAGTACAGCC GGGAGAAGAGAGAGAGTACAGCCTTACCATGTACACACACTCCAATCTCAACAGTCTCTTATATATGCTGCTGTTACCTGTGAGTGTGATGAAGGCTGTACCCTCTCTCTTCTTCT 1 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR529 0.000000007 zma-MIR529 0.0000000004 -54.7 ((((((((((((((.((((((((((..(((.....(((((((((.....((((((..(........)..))))))...)).)))))))))))))))))))).)))))))))))))) (-54.70)