mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCTTAAGTCAAACCTTTT AAGTTTTGATTTAAAATAAC CTATAGAATTATAAAATAATCTTTTACTCTCTCCATCACCGAATAAATCAATTCCTAAAGTTTTCTTAAGTCAAACCTTTTAAAGTTTAACAAAATTTATAGAAAAGAGCACCAAAATTTATGGCACTAGTATAAAATGTTGTCATAATATGCTGATTTGGTATCATAAATACTTGTGCTCTTTTCTACAAATTCAATCAAACGTAAAAAAAGTTTTGATTTAAAATAACTCTACGAATTGAATGGATTTATTTATGGATGGAGTGA 4 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase 100 100 -72.1 ...........................((.(((((((...((((((((((((((.((.((((...((((((((((.(((((...((((.....(((((.(((((((((((((....(((((((..(((((((((..(((....)))..)))))).....)))..)))))))....))))))))))))).))))).....)))).....))))).))))))))))...)))).)).))))))).....)))))))...))))))).)) (-72.10)