mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG GAGCTCCTTTCGGTCCAAAAAGG GAGCTCCTTTCGGTCCAAAAAGGGGTGTTGCTGTGGGTCGATTGAGCTGCTGGGTCATGGATCCCGTTAGCCTACTCCATGTTCATCATTCAGCTCGAGATCTGAAAGAAACTACTCCAATTTATACTAATAGTATGTGTGTAGATAGGAAAATGATGGAGTACTCGTTGTTGGGATAGGCTTATGGCTTGCATGCCCCAGGAGCTGCATCAACCCTACATGGACCCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCT 2 2 3' arm Triticum_aestivum mirbase MIR159 9e-143 osa-MIR159a 5e-144 -111.3 ((((((((((((((((((..(((((.(((..(((((((.(((..((((.(((((.((((.(..((((.((((((..(((..((((((((((((........))))..........(((.((((((((...........)))))))).)))..))))))))..((.....)))))..)))))).))))..).)))).))))).))))..))).)))).)))..))))))))))))))))))))))))))....... (-111.30)