mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCACG TGAGTTAATCCTGCGAGGGGAGTGAACGCGGTATTGGTGCGGTTCAATCAGAGAGCTGGCGCCCCAGGAGGCAAGGGGTTCCTCCCTTCGATTGAGCCGTGCCAATATCACGCGGTTTCTCATGAATCGCATCCTCCT 4 0 3' arm Triticum_aestivum mirbase MIR171_1 0.0000000001 bdi-MIR171c 8e-21 -62.3 .................(((((.((....((((((((..((((((((((..((.(..((.(((((.........))))).))..)))..))))))))))..))))))))..(((((((.....))))))).))))))) (-62.30)