mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCACGGCGTGATGCTGAGTCAG GGGTCAGCGTCGACGGCGGCGGCCGTG AGCGTCAGCGTGTGAGGCGCCAGCGCGCGCGGAGGAGGAGCTGGCTGGGTCAGCGTCGACGGCGGCGGCCGTGTGCTCCTACGTGGCACGGCGTGATGCTGAGTCAGCCAGTGGAGTGGTGCTACTTTTTACTAGGTGTGGAGTGGGAGTGCTATGCGCGGGGTCGCGTGACGTGG 3 3 3' arm Triticum_aestivum mirbase 100 far-MIR1119 0.000000000002 -85.5 .((((((.((((......(((..(((((...........(((((((((.((((((((.(((.((...((((((((....)))))))).)).))))))))))).)))))))))..((((.(.((((((..(((...)))..)))))).).))))..))))).))))))))))))).. (-85.50)