mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCACTATGGACTACATACGGAG TCGTATGTGGTTCATAGTAAAAT GTACTCTCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTTTATAGAAATTCCACTATGGACTACATACGGAGCAAAATAAATGAATCTACACTCTAAAATGCATCTACATACATTCGTATGTGGTTCATAGTAAAATCTCTACAAAGACTTATATTTAGAAACGGAGGGAGTAT 3 0 5' arm Triticum_aestivum mirbase MIR1122 4e-45 tae-MIR1122 1e-23 -73.27 ((((((((((((((.((((((((((((((((.((((.(((..(((((((((((((((((((......((.(((..................))).))......)))))))))))))))))))..))).)))).)))))))))))))))).)))))))))))))) (-73.27)