mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTACTCCCTCCGTCCGAAA CCGGACGGAGGGAGTAATTGC ATATGAGAGCATGGGTGAGAGGTGCTTAGTTACTACTCCCTCCGTCCGAAAATACTTGTCATCAAAATGAATAAAAAAGGGGATGTATCTAGAACTAAAATACATCTAGATACATCCCCTTCTATCCATTTTGATGACAACTATTTCCGGACGGAGGGAGTAATTGCTTCTTCTGGCTTGGCGTTTATGT 4 0 5' arm Triticum_aestivum mirbase MIR1122 8e-47 tae-MIR1136 0.00000000001 -99.5 (((((((.((.(((((.(((((.....(((...(((((((((((((((.(((((.((((((((((((((.(((...(((((((((((((((((...........))))))))))))))))).))).)))))))))))))).))))).)))))))))))))))...))).))))).))))))).))))))) (-99.50)