mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCGCAGGTATGGATGTATCTA AATACATCCATTTCTGCGACGAGT TACTCCCTCCGTTCCGAATTACTTGTCGCAGGTATGGATGTATCTAGATGTATTTTAGTTCTAAATACATCCATTTCTGCGACGAGTAATTTGAAACGGAGGGAGTA 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirbase MIR1122 2e-39 tae-MIR1135 1e-22 -69.9 (((((((((((((.((((((((((((((((((.((((((((((.((((...........)))).)))))))))).)))))))))))))))))).))))))))))))) (-69.90)