mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATTGGTGGAAGGCGTGGTA CACGACTTCCACCAATGTGA ACACAAAATCACATTGGTGGAAGGCGTGGTAAAGAAACAAAATCGATGCTTCGAAAATGTTACTTACAAAAGCATTTTGGAGTTTCGATTTTTTTTTGCACGACTTCCACCAATGTGATTTCGCGC 1 1 5' arm Triticum_aestivum mirbase 100 100 -55.9 .(.(.((((((((((((((((((.((((.((((((((...((((((.(((((.((((((((.........))))))))))))).)))))))))))))))))).)))))))))))))))))).).). (-55.90)