mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTTCTCTTTCTGTCAGC GGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACGCATCGGCCAGACTGCATCTATATACGGCTGCTCCTGGCGAATGGATAGATGCCAAGGCGCAGCTGCTGTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAGCT 0 2 5' arm Zea_mays mirbase mir-156 9e-61 sbi-MIR156f 2e-45 -68.5 ((((((((((((((((((((((((((.((((.(((.....)))......((((((.(((((((..........)))).))).)))))))))).))))))))))).)))).))))))))))) (-68.50)