mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCACA TGCTCTCTGCTCTCACTGTCATC CGAGTGGACCTCGGGAGCGATGACAGAAGAGAGAGAGCACAACCCAGCACCAGCGAGGAAAAGCCTCGCTTCTGCGAGGGCCGTGTGCTCTCTGCTCTCACTGTCATCGCCCACAGGCCACCGAA 1 2 5' arm Zea_mays mirbase mir-156 4e-41 sbi-MIR156d 2e-49 -77.5 ((.((((.(((..((.((((((((((.((((((((((((((.(((.(((..(((((((.....)))))))..)))..)))...)))))))))).))))..))))))))))))..))))))))).. (-77.50)