mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGATTGAAGGGAGCTCCT GAGCTCCCTTCGATCCAATCC ATGATTAAGAAAGGCGATCGAAGAGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGGGGAAGTGGTCGGTTGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTCTGGTGCAGCAATGGCCGCTGCTCACCTCTGCACTTGCATGGGTGTGCATGACCCGGGAGATGAGCCCGCCATCATCTTTCCCTCGTGCTTGGATTGAAGGGAGCTCCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTC 2 0 3' arm Zea_mays mirbase MIR159 5e-110 sbi-MIR159b 7e-81 -110.3 ..(((..(((.(((((...((.((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((((.((.((.((((.(((((.((((((....(((((((...((((....)).))...))))))).....)))))).))))).)))).)).)))))).))))....))))))))).)).)))))))))))))))))).))..))))).)))))).... (-110.30)