mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGAATGACTTGCCTA ATGCAATGTGGCTGCATCGGCAGGTCTTCTTGGCTAGC GTAGCCAAGAATGACTTGCCTATGCACGCCCTCTGTTGGCAGTTCCGTCCGGCAGCCATGGCGACGGTTGCACAAGGTGAGTTTTTGCGGCGTGGATGATGCAATGTGGCTGCATCGGCAGGTCTTCTTGGCTAGCCA 1 1 5' arm Zea_mays mirbase MIR169_5 2e-68 sbi-MIR169i 6e-28 -63.21 .((((((((((.((((((((.((.((((((((((.(((((((..(((((.(.((....)).)))))))))).))).).))).......)))))).))((((((.......)))))))))))))))))))))))).... (-63.21)