mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTCCTTGGCTACA GCAGCCAAGGATGACTTGCCGGGTATTTTGAGCATGCATGTTACAGGGGAGCATATGCAATCTGTTTGGAATTTTGAGCCCATACCGTGCGGTGCCTGTCTTCCGGCAAGTTGTCCTTGGCTACAT 3 0 5' arm Zea_mays mirbase MIR169_2 0.000007 vvi-MIR169c 0.0000004 -57.5 (.(((((((((..((((((((((......(.(((((((((.((...(((..((..(.(((.....))).)....))..))).)).))))).))))).....))))))))))..))))))))).).. (-57.50)