mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCCTACAAGCACTTCACGA AGTTCCCTACAAGCACTTCACGATACCTTGGCTTAATAAAGGCCAGTTGTGAAGTGTTTGGGGGAACTCT 1 1 3' arm Zea_mays mirbase mir-395 3e-19 zma-MIR395f 4e-27 -39.6 ((((((((.(((((((((((((((....((((((.....))))))))))))))))))))))))))))).. (-39.60)