mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGGGATCTTTTTGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTGCTTGTTGATCCATTAATTTTACGTATTCTCTCATAGATCTAGCATCTGAATGGTGGATAACAATATACGGATTCAGCTTATTTGGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATATATTGCTTCCAT GTCCGNATTCCCAGGCCGACCCACGCGTCCGCCCACGCGTCTTCCCACGCGTCCGTCCACGCGTCCGCCAGACTCTTGGGGGATAAAGGGAGTCTCGAGTGGAATTTTTGTGGAGTTTATTATTTTATTCTCATGTTACAAATGGAGGGGATCTTTTTGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACACTGCTTGTTGATCCATTAATTTTACGTATTCTCTCATAGATCTAGCATCTGAATGGTGGATAACAATATACGGATTCAGCTTATTTGGCGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATATATTGCTTCCATGGCGTTTTATCGAGGCTGCTGCATGTCCAGGATTGCTGTGCTTTTCTTTTTGCGGTTATTTTTATTGATATGTACTATATAATTTAGTATATGAATTTTGGTCGCACATTGGAGTTATGATGATTTTCTTTGACCATTTGTTCCATGAATATGTGTATCTTTACCCCCTATTTTTCTTTTTTTTATTCTTTTTCTTATGATGTTATCATCTCGTTTCTGTCACTTTCTTTTTTCCTTTTTTTCGATTATTAGTGTAGCAATCTTCTTCCCTCATGAGGCTTACTTGATTTTTTTTTCTTGTTCTTAAACTTTTAATTCTTGCTTTCAACTCAGGTGCGAATATCATTATACCCCTATATCTCTCGACTTTTTGTAAGATTAGGCATATTCTTTATTCCATTTTACTTCTTTGTGCTTTGTCGCCTTTCTACTTCTCGTTACTTTTTCTCATCATATATATAATAGCTCCTTGTTTAAAAAGCCCAACGTTTTTTCGTTTTTATAGCAATATATTCCTTTTGTTAGGTATATATTATATTTCCATGGGCCGTAATTAAACCCCTCACTTTTGTAAACCGNCGTTATCCCCTTTGCAAATCTTTTTTATATTCTTTTTTTGCTCCCCCGCTTTGTATTATTTGCTTT 4 0 5' arm Citrus_sinensis mirnest mir-166 0.0000000002 csi-MIR166e 4e-91 -48.9 ..(((......(((.(((.((((((((..((((((.((((.(((...(((.((((((((............(((((..((((((((.....))))..)))).))))).........))).)))))......)))))).)))).))))))..)))))))).))).))).....))).. (-48.9)