mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTGAGCGCAGCGTTGATG TAGCCGTTAGCGCTCATTAACT GTCATTGAGCGCAGCGTTGATGATGCGGAGCATGTACGTCTTCCCGGGCTTCACTTTCAGCTTGAACGTGTCTGCGTGCATGCATATCATAAGTATGGATATGAGTTAGTATAAAGAATCATAGCCGTTAGCGCTCATTAACT 6 1 5' arm Zea_mays mirbase 100 zma-MIR397b 0.00003 -43.44 ((...(((((((((((...(((((.(...((((((((((.....((((((........)))))).........))))))))))...(((((........)))))...........).)))))...)))).)))))))...)). (-43.44)