mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAATTGCCCTG GGGTACGTCTCCTTTGGCACA TGCTTGCTGAGCATGAATTACAGGGTACGTCTCCTTTGGCACAGCAGAATGCACACATCATCAGTCGAGAGAGTAAGCTCGCTGCGTGCTCGCCGGCCTGGGAGCGGAAGTCGCAGGCCAAATGGCGGCGGTGCAGATGCATGAACAGCAGCTGCCGTATATATGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTGCGATTCTAGGCTCAGCGAT 2 0 3' arm Zea_mays mirbase mir-399 0.00000000005 sbi-MIR399c 0.00000000000005 -108.3 ...(((((((((..((((..(((((((..(((((((((((((.(((..((((..........(.((....)).)..((..(((((..((.((((((((((.((.(....))).))))))....)))))).((((....)))).....))))).)).))))...))))))))))))))))..)))))))..))))...))))))))). (-108.30)