mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG CCTGTGCCTGCCTCTTCCATT GTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGGAGCACGAGCGAGGTGTGGCTGGAAGAAGCAGCCGGGGCCTGTGTGCTATATACCCCTCGCAAGCTCTCCTCACTCCTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCATT 2 0 5' arm Zea_mays mirbase 100 zma-MIR528b 0.0000004 -60.94 ((((((((((((.(((.(((((.((...(((.((((...(((((.......))))).((((.((((..............)))).)))).)))).)))))))))).))).)))))))))))). (-60.94)