mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCCGATGCCTCCCATTCCTA GGAATGGGAACATGGAGGAAAG TAAGAGCAGTGGGAATGGGAACATGGAGGAAAGCCCATCCTGTTGGTTTCCTCCTCCAGAAACCGAGGTGGAAGCTTGGTTCGGTGTTTCCCGATGCCTCCCATTCCTATTGTTCTTA 2 2 3' arm Zea_mays mirbase MIR2118 2e-49 osa-MIR2118n 0.0000000000004 -61.2 ((((((((((((((((((((.(((.(.((((((((...((....(((((((.((((........)))).))))))).))...))).)))))).)))..)))))))))))))))))))) (-61.20)