mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTAATGCCTCCCATTCCTA GGCATGGGAACATGGAGGAAGG GGAAGAGGAAGTAAAGATGATCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAGGCCTATGAGGTTGAAACCTCATTTTGTGTCTTCCTAATGCCTCCCATTCCTATCGTTCTTAGGTGATCCTTCCTCTTGC 3 2 3' arm Zea_mays mirbase MIR2118 3e-39 zma-MIR2118d 9e-36 -69.1 (.(((((((((....(((.((((((((((.(((((.((((((.(((..(((((((((.(((((((....)))))))...).)))))))).)))..)))))).))))).)))))))))).)))))))))))).) (-69.10)