mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTGATGCCTCCTATTCCTA GGAATAGGAACATGAAGGAAAG GCCAGGAAAAGGATGAAAGATTCTAAGAGCACTAGGAATAGGAACATGAAGGAAAGCATTATTGTGCATGGAGATTTAGGCCTGATGTTTTCCTGATGCCTCCTATTCCTAAGGCTCTTAGGTTCTCCTTCCCTTTCCTTATGGC 2 2 3' arm Zea_mays mirbase MIR2118 4e-48 osa-MIR2118j 0.000000000008 -63.1 (((((((((.(((....(((..((((((((..(((((((((((.(((..((((((((((((..(.((.(((....))).))))))))))))))).)))..)))))))))))..))))))))..)))...))).)))))...)))) (-63.10)