mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGGCTTCAAAGATTCGTCT ACGAATCTTTTGAGACTAATT TGAAAACTGCGAGACGAATCTTTTGAGACTAATTAAGCCATCATTAGCACATGTGGGTTACGGTAGTACTTATGGCTAATCACGGACTAATTAGGCTTCAAAGATTCGTCTCGCGATTTCC ATCGCCTGCCATGCTTGCACTACCTTACTAATCCTAACTCCACTGCTGATCACTGACTCGTTAGTATGTTTAATTCATTGTAATCATGTAATGTAATGGAGGTTGCTCTTTCTTTCCTCTATGTTTAGTTGGGGAAAAGAAAATTTTTAGGTGTCATGTCGAACGTTTGACCGGATGTCGGAAGGGGTTTTCGAACACGAATGAAAAAACTAATTTCAGAACTCGCCTGAAAACTGCGAGACGAATCTTTTGAGACTAATTAAGCCATCATTAGCACATGTGGGTTACGGTAGTACTTATGGCTAATCACGGACTAATTAGGCTTCAAAGATTCGTCTCGCGATTTCCTCCATAACTGTGCAATTAGTTTTTTCTTTTAATTTATATTTAATACTTCATACATGTGTCAAAAGATTCAATGTGATGTTTTTGAGAAAAAATTTTGGGAACTAAACGGGCCCTAAGTAACACTGTAATTTTCATTCTAATGAATTTCTTTTACTGTTGATTGCAAAAAAAA 2 0 3' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR2124a 0.000002 -43.1 .((((..((((((((((((((((.(((.(((((((..((...((((((.((((..(((.((....)))))))))))))))...))..))))))).))).)))))))))))))))).)))). (-43.1)